چکیده

چکیده قارچ فوزاریوم یکی از متنوع ترین قارچها در دنیا می باشد و دارای فرم های تخصصی متعددی است که در موجودات زنده مختلف توانایی بیماریزایی دارد. بمنظور تعیین ارتباط مقابل تنوع زیستی و منشاء جغرافیایی با تنوع ژنتیکی، یکی از مهمترین فرم های تخصصی بیماریزای این قارچ، Fusarium oxysporum f. sp. sesami از گیاهچه های کنجد شهرستان های مختلف استان فارس جداسازی شد. پس از شناسایی دقیق قارچ و اثبات بیماریزایی 65 جدایه، با استفاده از روش های موفولوژیک، بیولوژیک و مولکولی اقدام به بررسی تنوع موجود در جدایه ها گردید. با تولید جهش یافته های نیت و تقابل همه جدایه ها، چهار گروه بر اساس سازگاری رویشی (VCG) بین همه جدایه ها تشخیص داده شد. تمام جدایه های مربوط به داراب در گروه اول، تمام جدایه های استهبان در گروه دوم و تمام جدایه های نورآباد در گروه چهارم قرار گرفتند. در گروه سوم جدایه های ارسنجان و نی ریز مشاهده شد. بمنظور تعیین تنوع ژنتیکی، ابتدا DNA تمام جدایه ها استخراج و سپس با استفاده از نشانگر RAPD و 13 آغازگر تصادفی، تنوع ژنتیکی بررسی شد. نتایج حاصل، جدایه ها را در شش گروه قرار داد. ارتباط تنوع ژنتیکی و منشاء جغرافیایی در تمام گروه ها کاملا مشخص بود. بعنوان مثال تمام جدایه های داراب در گروه اول قرار داشت. بمنظور استفاده از نشانگر مولکولی RFLP، ابتدا ناحیه IGS از DNA ریبوزومی با استفاده از جفت آغازگر CNS1 و CNL12 تکثیر شد و با استفاده از پنج آنزیم برشی، هضم آنزیمی این قطعات انجام گرفت. نتایچ نشان داد جدایه های این قارچ در پنج گروه RFLP قرار گرفتند. بعنوان مثال در گروه اول تمام جدایه های داراب وجود داشتند. بمنظور تعیین عوامل موثر بر تنوع ژنتیکی، با استفاده از نرم افزار POPGENE صفات مختلف ژنتیکی از جمله مهاجرت ژنی، چند شکلی ژنی بین و درون جمعیت های شهرستان های مختلف بررسی شد و دلیل همبستگی بین منشاء جغرافیایی و تنوع ژنتیکی مشخص شد. جهت انجام مطالعات تکمیلی ژن بتاتوبولین جدایه ها تکثیر و پس از تعیین توالی، درخت فیلوژنتیکی بر اساس روش Neighbor-Joining و Maximum parsimony رسم شد. در هر دو درخت فیلوژنتیکی، جدایه های شهرستان های مختلف در شاخه های مجزایی قرار داشتند. یکی از مهمترین دلایل این همبستگی استفاده کشاورزان از بذرهای سال قبل و عدم انتقال بذور بین شهرستانهای مختلف بوده است. تنوع زیستی و منشاء جغرافیایی و تنوع ژنتیکی این قارچ در استان فارس همبستگی بسیار بالایی را نشان داد. Abstract Fusarium in one of the most various fungi in the world and has numerous forma specials, that can create diseases in different living organisms. In order to determine of relation between biodiversity, geographic region and genetic diversity, one of the most important of pathogenic forma specials Fusarium oxysporum f. sp. sesami isolated from sesame seedlings in different cities of Fars providence. After detail diagnosis and pathogenicity test of 65 isolates, diversity were investigated by using of morphologic, biologic and molecular methods. With produce of Nit mutants and dual of isolates, four VCG groups identified between isolates. All of Darab isolates placed in group 1. All of Estahban isolates placed in group 2 and all of Noor Abad isolates placed in group 4. In group 3, were Arsanjan and Neyriz isolates. In order to determine of genetic diversity, at first DNA of isolates were extracted then investigated genetic diversity by using of RAPD marker with 13 random primers. The result showed six groups. Correlation between genetic diversity and geographic origin of isolates was distinguished. For example, all of Darab isolates placed in group 1. For using of RFLP marker, at first, IGS of rDNA was amplified by two primers CNS1 and CNL12 and digested by using five restriction enzymes. The result showed five groups. For example, all of Darab isolates placed in group 1. For determining of the factors that influenced on genetic diversity, used POPGENE software and determined different genetic characteristics includes gene migration, gene polymorphism inter and intra populations of different cities and distinguished the reason of correlation between geographic region and genetic diversity. For the complementary investigation, amplified ß-Tubulin gene and after sequencing, was drown phylogenetic trees according to Neighbor-Joining and Maximum Parsimony. In both phylogenetic trees, isolates of each cities placed in separated branch. One of the most important reasons of this correlation was the using of seeds of previous year and lack of translocation of seeds between cities. Correlation of biodiversity, geographic region and genetic diversity of Fusarium in Fars Province was very high.

کليدواژه ها

واژه های کلیدی: بیماریزا، موفولوژیک، بیولوژیک، مولکولی Key words: Pathogenic, Morphologic, Biologic, Molecular,

کد مقاله / لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله، می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است :

نحوه استناد به مقاله

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
صدیقه محمدی , 1399 , همبستگی تنوع زیستی، منشاء جغرافیایی و تنوع ژنتیکی در قارچ فوزاریوم در استان فارس , اولین کنفرانس ملی تنوع زیستی فارس