چکیده

ويروس موزائيك رگه اي گندم (Wheat streak mosaic virus) از جنس Tritimovirus و خانواده Potyviridae می باشد که در بیشتر مناطق ایران روی گندم گزارش شده است و در شرایطی باعث نابودی کامل محصول نیز می شود. با توجه به تغییر الگوی کشت در سالیان اخیر، شرایط مساعدتری برای انتشار این ویروس فراهم شده که باعث شیوع و خسارت بیشتر این بیماری ویروسی در مزارع گندم گردیده است. مشخص شده است که پروتئین پوششی این ويروس در حرکت، تکثیر ژنوم و انتقال با ناقل نقش دارد. در این مطالعه، آنالیز تنوع ژنتیکی و خصوصیات تکاملی توالی های نوکلئوتیدی پروتئین پوششی ۲۷ جدایه ایرانی ویروس موزائيك رگه اي گندم با استفاده از نرم افزارهای DnaSP (Ver. 6.12.03) و MEGA (Ver. 6.06) انجام گرفت. نتایج نشان داد که پروتئین پوششی ویروس دارای ۹۸۱ جایگاه پلی مورفیک و ۱۷۴۹ جهش می باشد. تعداد ۲۷ هاپلوتایپ با میزان تنوع یک و واریانس تنوع ۰۰۰۱/ مشاهده شد. میزان تنوع نوکلئوتیدی با نرخ ۴۶۲۰۷/Pi: و میانگین تفاوت های نوکلئوتیدی با ۱۷۴/۴۸۵k: مشاهده شد. همچنین در این بررسی تعداد حداقل ۹۹ نوترکیبی (۹۹Rm:) بین جایگاه های نوکلئوتیدی مختلف یافت شد. آزمون Tajima s D بیانگر انتخاب در حال تعادل در ژن پروتئین پوششی بین جدایه های ويروس موزائيك رگه اي گندم بود. همچنین آنالیز Maximum Likelihood انتخاب طبیعی بین کدون ها نشان داد که میزان dN-dS در بیشتر موارد منفی می باشد که بیانگر تعادل در انتخاب از طریق حذف تغییرات ژنتیکی مضر و پایداری ژن می باشد. در نهایت، تغییرات قابل توجهی (جهش و نوترکیبی) در ژن پروتئین پوششی جدایه های مختلف ویروس موزائيك رگه اي گندم یافت شد که احتمال داده می شود روی شدت بیماریزایی جدایه های مختلف اثرگذار باشند.

کليدواژه ها

تغییرات ژنتیکی، توالی های نوکلئوتیدی، جدایه های ویروس، ویروس گیاهی.

کد مقاله / لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله، می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است :

نحوه استناد به مقاله

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
محمدحامد قدوم پاریزی پور , 1399 , بررسی تنوع ژنتیکی و خصوصیات تکاملی پروتئین پوششی ويروس موزائيك رگه اي گندم , اولین کنفرانس ملی تنوع زیستی فارس